民国西式医学院的学生陈锦生，帮助师叔冷大师经营私家侦探社“福摩侦探社”，前清第一快刀刘一刀被徒弟牛二屠门，陈锦生和冷大师通过蛛丝马迹查案，但北城富豪田不换、南城粮商范不着、前朝大员增世梁家，诡异的案件仍然在接连发生……鬼市？监牢？风水？五行？到底是谁在暗中操纵！仇杀？情敌？春药？蛊毒？到底是谁在掌控一切！

本片讲述年轻的燕赤霞成天打着自己老爹天下第一驱魔师旗号混吃等死，在和驱魔师时镖打赌的过程中误打误撞将兰若寺树妖姥姥的本命法器镇魂玲拿走。一位年轻的驱魔师和一位失去法力的树妖姥姥经历一系列搞笑、感动、峰回路转的事件，最终燕赤霞遵循本心除魔卫道维护正义，一心修炼成长为一代捉妖大师的故事。

张影月和张星月是一对孪生姐妹花，姐姐影月外向嫉恶如仇，妹妹星月内向胆小，二人素有心灵感应。一个狂风暴雨之夜，星月惨遭蹂躏而死，影月到案发现场，感应到可能的疑犯有四人……　　张影月假装星月鬼魂向第一疑犯陈兆昌逼供，不料陈兆昌却被吓死。第二疑犯马国标热心公益，直觉告诉影月，他没可能是害死妹妹的变态凶徒。第三疑犯徐元科好色贪小便宜，却被神秘勒杀；最后一个疑犯是道貌岸然的曾英明，竟然被发现在汽车内烧炭自杀。　　所有线索完全断掉，更不幸的事发生了，一起帮她查案的好友阿仪死于冷枪之下！影月背负着复仇的痛苦、面对死亡的

驱魔大师林九的徒弟刘一泽，在向心上人丁香提亲之时，发现丁家被狐妖所控制，一阵斗法后，误以为狐妖已被师傅封印，在黄妖小曦的提醒下，发现狐妖附身在了林天师身上，在激烈的打斗中，林天师为了保护众人，用桃木剑刺进自己的心脏，与狐妖同归于尽，临死前传位于刘一泽，刘一泽因此成为了新一任驱魔天师，替师傅去完成未完成的使命。

青之驱魔师所讲述的世界由两个空间组成，并且像镜子般连为一体。人类居住的物质界为本作舞台，另外还有恶魔居住的虚无界。平常基本上无法接触或穿梭于两界之间。可是恶魔能凭依于相当的物质从而进入人类的世界。撒旦乃众魔之神，为了从人间捡回一个能抑制他的箱子，而诞下了奥村磷——他跟一人界女子的儿子。可是撒旦的密谋未能得到到磷的认同。之后撒旦杀掉了磷的监护人养父，并要带磷返去虚无界。这使磷开始了驱魔师之旅，就为了打败他的生父撒旦。

汉末年间天地灵气无故消失殆尽，盛极一时的驱魔司分崩离析，史称“万法归寂”。晋太元四年，世间仅存的唯一一位大驱魔师——陈星来到襄阳寻找自己命定的护法武神。依靠着寄宿在他魂魄中的法器心灯，陈星努力寻找着恢复天地灵气的方法以对抗即将复苏的天魔，也在旅途中与护法武神项述结下深厚友谊。该动画将融合古风、神魔、奇幻、战斗等元素，向观众呈现一段波澜壮阔、跌宕起伏的英勇传奇故事。