影片根据安东尼·约翰斯顿（Antony Johnston）的同名小说改编，讲述了“冷战”结束前的间谍行动：1989年，民主德国局势发生急剧变化，“柏林墙”面临拆除的命运，但此时也是最黑暗的时刻，各种暗杀行动时有发生。一位英国军情六处的地下官员在柏林遇刺，他掌握了从民主德国带回来的一份间谍名单，但杀手在他身上并未找到。一位名叫洛林·布劳顿（塞隆 饰）的特工，肩负起找回这份间谍名单的任务。

蓝精灵们一直在逃避邪恶巫师格格巫的追捕，笨笨误将大家带进了禁地石窟，由于当时是蓝月，所以大伙都被传送到了当今世界的纽约中央公园内。在这里他们一方面要赶在格格巫和阿兹猫（Azrael）找到他们之前回到自己的蘑菇村庄，另一方面只有三个苹果高的他们也要在纽约这座大苹果之城展开冒险。

父亲的突然去世让汤米一家人陷入了混乱，家庭无人照料一片狼藉，母亲终日哭泣郁郁寡欢，就在这样一种糟糕的情况下，汤米迎来了自己躁动又不安的青春，无处发泄的他只能通过调皮捣蛋来纾解心中的积怨。辍学后的汤米在一家熟食店打工，负责送货。  汤米和朋友帕鲁帕斯成天厮混在一起，帕鲁帕斯是一个外表成熟但心智幼稚的“大龄儿童”，两人之间的感情真挚又深厚。一次意外中，汤米结识了蕾蒂，后者带领他进入了成年人的世界，享受了爱情的甜蜜与苦涩。一场意外的发生摧毁了汤米自由的生活，它不仅终结了汤米的现在，也波及到了他的未来。

格格巫(Gargamel)为了获得强大神奇的蓝精灵汤，制造了一些长相酷似蓝精灵但皮肤是灰色的“淘气精灵”(Naughties)，然而很快他就发现只有真正的蓝精灵才有用，而要想把这些淘气精灵变成真正的蓝精灵，需要一句只有蓝妹妹才知道的秘密咒语。格格巫绑架了蓝妹妹，把她带到了巴黎，因为他要在这里接受“世界上最伟大的魔法师”大奖。为了救回蓝妹妹，蓝爸爸(Papa)、笨笨(Clumsy)、厌厌(Grouchy)、靓靓(Vanity)再度出发来到人类世界，向他们的人类朋友帕特里克和格雷斯求助……